Cụ thể: Chủ tịch UBND tỉnh Ninh Bình giao UBND thành phố Ninh Bình chủ trì, phối hợp với các cơ quan, đơn vị có liên quan tập trung cao nhất cho công tác giải phóng mặt bằng các dự án để tiếp tục bàn giao mặt bằng các vị trí còn lại cho chủ đầu tư, nhà thầu triển khai thi công, trước mắt bàn giao ngay mặt bằng đoạn qua nhà khách Tỉnh uỷ và đoạn qua trụ sở Sở GTVT. Phối hợp chặt chẽ với Sở TNMT và các đơn vị liên quan trong việc lập phương án đền bù, hỗ trợ giải phóng mặt bằng theo quy định, khẩn trương giải quyết các vị trí vướng mắc về mặt bằng.
Đồng thời, Sở NN&PTNT (Chủ đầu tư) phối hợp với Sở Xây dựng, UBND thành phố Ninh Bình nghiên cứu phương án điều chỉnh theo hướng mở rộng thêm lòng sông Vân đối với đoạn sông khu vực đầu cầu Lim và đoạn cầu Vân Giang. Kiểm tra, tính toán kỹ việc lựa chọn cao độ khoá mũ đầu cọc kè bờ sông để đảm bảo mỹ quan công trình, phù hợp với cảnh quan đô thị.
Cùng với đó, Sở NN&PTNT và Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình giao thông kết hợp chặt chẽ trong việc triển khai thi công đồng bộ các hạng mục thuộc Dự án xây dựng Cụm công trình thuỷ lợi Nam sông Vân và Dự án đầu tư xây dựng cầu Chà Là. Chỉ đạo nhà thầu thi công thực hiện nghiêm công tác đảm bảo an toàn giao thông, an toàn lao động và vệ sinh môi trường theo quy định. Tập trung đẩy nhanh tiến độ thi công phần kè bờ Đông sông Vân đoạn từ cầu Vân Giang đến khách sạn Hoàng Gia và phần nút giao phía đường Lê Đại Hành của Dự án cầu Chà Là, hoàn thành trước Tết Nguyên đán năm 2023.
Ngoài ra, đối với hạng mục cụm đầu mối trạm bơm Khánh An I, Sở NN&PTNT chủ trì, phối hợp với Sở GTVT, UBND huyện Yên Khánh yên cứu phương án nâng cấp bờ kênh kết hợp đường giao thông kết nối từ quốc lộ 10 đến tuyến đường đê hữu sông Đáy để phát huy hiệu quả đầu tư dự án.
Trước đó, như Lao Động đã thông tin "Dự án Cụm công trình thuỷ lợi 600 tỉ đồng vướng giải phóng mặt bằng", phản ánh việc triển khai thực hiện Dự án Cụm công trình thuỷ lợi Nam sông Vân 600 tỉ đồng trong quá trình triển khai thi công đang vướng giải phóng mặt bằng. Như đoạn tuyến qua chợ Rồng chưa có phương án di chuyển các khu chợ nằm trong phạm vi thực hiện dự án; Khu vực dân cư giáp khách sạn Hoàng Gia, khu dân cư phố 4, phường Vân Giang (xóm Bún) một số hộ chưa chấp thuận phương án và đơn giá đền bù GPMB, trong đó khu dân cư bờ Đông sông Vân giáp khách sạn Hoàng Gia hiện đang vướng 10 hộ thuộc Khu tập thể đầu máy đường sắt được cấp nhà tập thể nhưng không được cấp đất; Tuyến kè sông Vân cắt qua hệ thống đường ống ngầm thoát nước thải, hệ thống cáp điện ngầm, hệ thống PCCC của chợ Rồng, quá trình thi công phải phối hợp với các đơn vị liên quan để thống nhất biện pháp thi công hoàn trả, do đó làm chậm tiến độ thi công của dự án.
Đối với Cụm đầu mối trạm bơm Nam thành phố: Các hộ dân thuê đất của phường Bích Đào để làm kinh doanh dịch vụ (đất thuộc phạm vi hành lang đê và đất ngân sách) không phối hợp, thường xuyên gây khó dễ cho chủ đầu tư và đơn vị thi công.
Đối với Cụm đầu mối trạm bơm Khánh An 1, hiện một số hộ dân lấn chiếm đất (đất thuộc phạm vi công trình thuỷ lợi) để trồng cây trong phạm vi thực hiện dự án không phối hợp thực hiện giải phóng mặt bằng.
