Theo Sở Giao thông Vận tải, hiện nay các tuyến đường thủy nội địa trên sông Sài Gòn, sông Chợ Đệm - Bến Lức, rạch Ông Lớn do Sở quản lý. Đồng thời, Chi cục Đường thủy nội địa phía Nam cùng thực hiện công tác đảm bảo an toàn giao thông.
Việc cả hai cấp cùng quản lý trên một tuyến sông khiến việc sửa chữa duy tu gặp khó khăn, không đảm bảo tính đồng bộ trong quản lý các bến thủy. Trong khi đó, thành phố có các lực lượng chức năng, có đầy đủ điều kiện và công cụ để thực hiện công tác quản lý hiệu quả.
Do đó, Sở đề xuất được Bộ Giao thông Vận tải phân cấp cho TP HCM quản lý toàn diện các tuyến đường thủy nội địa bao gồm 5 tuyến nêu trên với tổng chiều dài 56,8 km để thành phố toàn quyền quản lý khai thác cũng như duy tu, sửa chữa.
