Viện kiểm sát nhân dân TP. Vũng Tàu đã đề nghị mức xử phạt từ 3-4 năm tù đối với hành vi dâm ô của Nguyễn Khắc Thủy được quy định tại khoản 2, Điều 116 của Bộ luật Hình sự. Theo vị đại diện Viện kiểm sát giữ quyền công tố tại tòa, đây là mức án nghiêm khắc đối với hành vi dâm ô đối với trẻ em vị thành niên, dù đối tượng phạm tội trong vụ án này là người lớn tuổi. Bản án này là thông điệp có đủ sức răn đe đối với những ai có hành vi xâm hại tới trẻ vị thành niên.
Bào chữa cho bị cáo trước tòa, 2 vị luật sư của Nguyễn Khắc Thủy cho rằng chưa có đủ căn cứ để buộc tội bị cáo Nguyễn Khắc Thủy phạm tôi dâm ô. Cần làm rõ những tình tiết chưa hợp lý trong vụ án, cơ quan điều tra đã vi phạm nghiêm trọng các bước tiến hành tố tụng khi tiến hành điều tra vụ án này.
Cụ thể như tiến hành điều tra, thực nghiệm vụ án..., trước khi có quyết định khởi tố vụ án và bị can. Bào chữa cho mình trước tòa, bị cáo Nguyễn Khắc Thủy khẳng định không có chuyện ông có hành vi dâm ô đối với trẻ em như lời buộc tội của Viện kiểm sát và nếu bị buộc tội, ông sẽ tự thiêu.