Ông Trúc liên quan đến vụ án "Vi phạm các quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí". Cùng với án tù treo, ông Trúc bị kỷ luật Đảng với hình thức khai trừ Đảng.
Trước đó, Công an tỉnh Gia Lai khởi tố vụ án hình sự để điều tra, làm rõ về các sai phạm tại dự án xây dựng phần mềm và cơ sở dữ liệu quản lý cán bộ, công chức, viên chức trên địa bàn tỉnh Gia Lai do Sở Nội vụ làm chủ đầu tư.
Hệ thống phần mềm này không thể sử dụng nhưng vẫn được nghiệm thu, thanh quyết toán, gây thất thoát, lãng phí tiền ngân sách nhà nước gần 1 tỉ đồng.
Liên quan vụ án này, Viện KSND tỉnh Gia Lai truy tố ông Huỳnh Văn Tâm - nguyên Giám đốc Sở Nội vụ; Phó Ban Thường trực Ban Tổ chức Tỉnh ủy) về tội “Thiếu trách nhiệm gây hậu quả nghiêm trọng”; Hồ Quang Thi (44 tuổi, trú phường Hoa Lư, TP Pleiku, cựu Kế toán trưởng Sở Nội vụ) bị truy tố về tội “Tham ô tài sản”; Nguyễn Đình Trúc (Phó Chánh Văn phòng Sở Nội vụ tỉnh) về tội "Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát, lãng phí".
Tháng 10.2023, TAND tỉnh Gia Lai xét xử, tuyên phạt bị cáo Huỳnh Văn Tâm 30 tháng tù cho hưởng án treo, Nguyễn Đình Trúc 18 tháng tù cho hưởng án treo và Hồ Quang Thi nhận án 11 năm tù giam.