Theo cáo trạng của Viện KSND tỉnh Hòa Bình, năm 2011, Hợp tác xã (HTX) Nghĩa Phương có chủ trương xây dựng, sửa chữa, cải tạo và nâng cấp chợ Nghĩa Phương. Tuy nhiên, do khó khăn về kinh phí, HTX Nghĩa Phương mới chỉ thực hiện xây dựng, sửa chữa, cải tạo và nâng cấp được một số hạng mục.
Từ năm 2016-2017, Khuê với vai trò là Giám đốc HTX Nghĩa Phương đã lợi dụng chức vụ của mình, ký 8 hợp đồng với 8 hộ cá nhân thuê 9 ki ốt theo hình thức cho thuê 10 năm với số tiền 1,8 tỉ đồng.
Sau khi thu tiền của các hộ cá nhân, Khuê sử dụng số tiền này vào mục đích cá nhân, không thông báo, không nộp số tiền đã thu vào quỹ của HTX.
Khuê dùng thủ đoạn gian dối, sử dụng phiếu thu có chữ ký khống của thủ quỹ, không thông báo, không nhập tiền vào quỹ HTX.
Bị cáo này bỏ ngoài hệ thống sổ sách kế toán của HTX Nghĩa Phương nhằm che dấu và thoát khỏi sự theo dõi, quản lý của HTX Nghĩa Phương để chiếm đoạt tiền.
Quá trình điều tra, Khuê giải trình số tiền 1,8 tỉ đồng thu được từ việc cho thuê 9 ki ốt của HTX được Khuê sử dụng vào việc xây dựng, sửa chữa, cải tạo chợ Nghĩa Phương. Tuy nhiên, kết quà điều tra xác định không có tài liệu thể hiện việc Khuê đã chi số tiền này vào việc xây dựng, sửa chữa chợ Nghĩa Phương.
Ngoài ra, Nguyễn Văn Khuê đã duyệt chi tạm ứng số tiền hơn 2,6 tỉ đồng từ quỹ của HTX cho ông Nguyễn Công Chính (thành viên HTX Nghĩa Phương) để xây dựng, sửa chữa, cải tạo và nâng cấp chợ Nghĩa Phương. Sau khi nhận tiền tạm ứng, ông Chính đã giao lại toàn bộ số tiền cho Khuê trực tiếp quản lý, sử dụng.
Đến nay, Khuê mới nộp cho HTX Nghĩa Phương 13 hóa đơn với tổng số tiền hơn 200 triệu đồng có liên quan đến việc thực hiện xây dựng, sửa chữa, cải tạo và nâng cấp chợ. Số tiền hơn 2,4 tỉ đồng còn lại, Khuê chưa có chứng từ để thanh, quyết toán với HTX.
