"Quỳnh búp bê" đã kết thúc với cái kết: Vũ trả lại con cho Quỳnh, sau đó Quỳnh và con trai sống yên bình ở một vùng quê ven biển, Lan bất ngờ khỏi bệnh rồi được cả gia đình yêu thương, gã bố dượng bị xe tông còn My "sói" bị công an bắt vì tội tàng trữ ma túy trái phép; Cảnh bất ngờ trở lại, cưỡi motor với vẻ điển trai và phong độ; duy chỉ có Nghĩa là mất tích hoàn toàn khỏi tập cuối.
Được ủng hộ từ những ngày đầu phát sóng bao nhiêu, kết phim "Quỳnh búp bê" dù có hậu nhưng vẫn gây tranh cãi cho người xem. Bởi trước đó, theo như lời "cảnh báo" của biên kịch Kim Ngân cũng như nữ chính Phương Oanh, "Quỳnh búp bê" sẽ có cái kết đầy ám ảnh. Đa số các ý kiến trên fanpage của phim đều nhận xét kết phim quá nhạt và có nhiều chi tiết vô lý, gây khó hiểu.
Một khán giả bày tỏ ý kiến: "Phần 1 phim quá hay, phần 2 lúc Quỳnh thoát khỏi Thiên Thai thì thi thoảng có 1 vài cảnh hay, còn lại rối rắm, không rõ tuyến nhân vật chính là ai ở phần 2. Không nên có phần 3 vì phần 2 đã quá nhạt rồi. Phim hay phải ấp ủ vài năm, không nên vì khán giả quá thích mà ra vội vàng hỏng cả thương hiệu bộ phim".
Khán giả có tên Facebook Hoa Xương Rồng bình luận: "Thật sự không thích kết phim vì chưa giải quyết được hết vấn đề vì sự thật vẫn chưa được sáng tỏ, nhân vật Cảnh cho đến khi chết vẫn bị coi là kẻ giết người".
"Thật sự không thích kết phim vì chưa giải quyết được hết vấn đề", "đúng phim Việt Nam chưa bao giờ hết nhảm, kết thúc quá nhạt", "Trời ơi, phí 50 phút cuộc đời để xem tập cuối", "Kết phim chả ra làm sao", "Tập cuối nhạt, các tình tiết không cho biết diễn biến mà chỉ thể hiện kết quả bằng chữ "một thời gian sau'... hẫng, quá hẫng"... là những bình luận của cư dân mạng dành cho bộ phim. Nhiều người bày tỏ cảm giác hẫng hụt vì trông đợi một cái kết ấn tượng hơn của "Quỳnh búp bê".
Gần nửa năm công chiếu, "Quỳnh búp bê" là bộ phim truyền hình tiếp theo sau "Người phán xử", "Sống chung với mẹ chồng" nhận được sự quan tâm từ đông đảo khán giả. Từng có thời gian dừng phát sóng vì có nhiều cảnh nhạy cảm nhưng không vì vậy mà phim giảm đi sức hút của mình khi lấy chủ đề những cô gái làng chơi.