Hệ số lương của Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang bộ được Ủy ban thường vụ Quốc hội phê chuẩn theo Bảng lương chức vụ đối với cán bộ lãnh đạo của nhà nước ban hành kèm theo Nghị quyết 730/2004/NQ-UBTVQH11 ngày 30.9.2004 của Uỷ ban thường vụ Quốc hội.
Bên cạnh đó, Nghị quyết 128/2020/QH14 ngày 12.11.2020 của Quốc hội về dự toán ngân sách nhà nước năm 2021 thì Quốc hội đã quyết định chưa thực hiện điều chỉnh mức lương cơ sở.
Theo đó, chức danh Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang bộ có 2 bậc hệ số lương là 9,7 và 10,3.
Cụ thể, với lương bậc 1, mức lương Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang bộ có hệ số 9,7 nhân với lương cơ sở 1,49 triệu đồng cho ra mức lương Bộ trưởng mỗi tháng theo quy định là 14.453.000 đồng.
Với hệ số lương bậc 2, mức lương Bộ trưởng và Thủ trưởng cơ quan ngang bộ có hệ số 10,3 nhân với lương cơ sở 1.490.000 đồng ra mức lương Bộ trưởng mỗi tháng là 15.347.000 đồng.
Ngoài hưởng lương, Bộ trưởng, Thủ trưởng cơ quan ngang Bộ còn được hưởng thêm một số phụ cấp kèm theo tùy mỗi chức danh, lĩnh vực như: Phụ cấp thâm niên vượt khung, phụ cấp kiêm nhiệm chức danh, phụ cấp chức vụ lãnh đạo, phụ cấp đặc thù theo nghề hoặc công việc…