Vụ việc bị phát hiện vào giữa năm 2015 và vẫn đang trong giai đoạn điều tra.
Theo đó, có 213 container của 56 doanh nghiệp vận chuyển quá cảnh qua cảng Cát Lái – TPHCM (cửa khẩu nơi đi) để trung chuyển bằng đường bộ, sau đó xuất đi Campuchia (cửa khẩu nơi đến), tuy nhiên, số container trên đã được doanh nghiệp vận chuyển khỏi cảng Cát Lái nhưng không được đưa đến cửa khẩu xuất theo quy định.
Về vụ việc này, Bộ Tài Chính đã có báo cáo gửi Thủ tướng Chính phủ để xử lý kỷ luật tạm thời 29 cán bộ hải quan của Cục Hải quan TP.HCM liên quan trực tiếp đến vụ việc, trong đó có một số lãnh đạo, người đứng đầu đơn vị hải quan ở mức khiển trách và hạ mức phân loại cán bộ.
Tuy nhiên, ngay sau đó, Bộ Tài chính cho biết: "Kết quả xử lý của Cục Hải quan TP.HCM chưa được. Mức xử lý chưa nghiêm khắc, chưa đảm bảo tính răn đe, phòng ngừa sai phạm; chưa tương xứng với hậu quả xảy ra".
Theo chỉ đạo của Phó Thủ tướng Trương Hòa Bình, Bộ Tài chính phải thực hiện nghiêm ý kiến chỉ đạo của Phó Thủ tướng thường trực - Trưởng Ban Chỉ đạo 389 quốc gia đối với vụ việc nghiêm trọng này.
Phó Thủ tướng yêu cầu một lần nữa Tổng cục Hải quan khẩn trương thực hiện lại việc kiểm điểm trách nhiệm của các cá nhân có liên quan, nhất là người đứng đầu các cơ quan, đơn vị để xảy ra vụ việc 213 container hàng hóa quá cảnh nhưng không xuất cảnh, đảm bảo nghiêm minh, đúng quy định của pháp luật; báo cáo Thủ tướng Chính phủ kết quả trước ngày 1.5.2018.
Theo đó, Tổng cục Hải quan phải báo cáo Thủ tướng Chính phủ kết quả xử lý theo chỉ đạo nói trên trước ngày 1.2.2018.
Trong chỉ đạo trước đó, Phó Thủ tướng Trương Hòa Bình cũng đề nghị Bộ Tài chính - cơ quan thường trực của Ban chỉ đạo 389 quốc gia, chủ trì phối hợp với các cơ quan liên quan rà soát, sửa đổi, bổ sung các quy định về giám sát hàng quá cảnh, hàng tạm nhập tái xuất, hàng chuyển cửa khẩu, hàng trung chuyển… đảm bảo hàng hóa không bị tháo dỡ, tẩu tán, thẩm lậu trên đường vận chuyển.
