Ngày 5.9.2018, tại Km136+105 tuyến cao tốc Nội Bài - Lào Cai (thuộc địa phận xã Quy Mông, huyện Trấn Yên, tỉnh Yên Bái) xảy ra vụ TNGT nghiêm trọng giữa xe tải xitec chuyên chở nhiên liệu - xăng dầu, BKS 89C-124.94, lưu thông hướng Nội Bài - Lào Cai, khi đến địa điểm cầu Ngòi Thủ (Km136+108) bị mất lái đã đâm va với ôtô 5 chỗ, hiệu Mazda CX5, BKS 30F-190.74 đang lưu thông theo hướng ngược lại. Sau khi đâm va với xe ôtô Mazda CX5, xe xitec tiếp tục đâm gẫy lan can bên trái cầu Ngòi Thủ và rơi xuống khu vực gần cầu rồi bốc cháy. Nhiệt độ cao từ vụ cháy xe xitec đã ảnh hưởng rất lớn đến kết cấu bêtông của cầu Ngòi Thủ, không đảm bảo an toàn cho các phương tiện lưu thông qua đây cũng như an toàn công trình.
Để đảm bảo giao thông tại khu vực không bị gián đoạn, ngày 27.9.2018 VEC đã triển khai thi công đường tạm phục vụ thông xe qua khu vực cầu Ngòi Thủ, đủ năng lực tiếp nhận tất cả các loại phương tiện, với tốc độ lưu thông khoảng 40km/h.
Theo đại diện VEC, công tác sửa chữa, khắc phục sự cố cầu Ngòi Thủ (Km136+108) bao gồm 6 hạng mục gồm: Sửa chữa hư hỏng mố A1: Đục tẩy hết phần bêtông tường thân và tường cánh bị hư hỏng, sau đó tiến hành khoan cấy, bổ sung cốt thép và bọc lại phần bê tông, trả lại nguyên dạng hình dáng và kích thước ban đầu; Thay thế gối cầu cao su cốt bản thép trên mố A1 bằng gối cầu caosu cốt bản thép mới; Thay thế hệ dầm I BTCT DƯL cũ đã hử hỏng bằng hệ dầm I BTCT DƯL mới, chiều dài 33,0m; Thay thế mặt cầu BTCT cũ bằng mặt cầu BTCT mới, thảm lớp phủ bêtông nhựa; Thay thế khe co giãn dạng ray cũ bằng khe co giãn dạng ray mới và thay thế hệ thống lan can phần hư hỏng, thoát nước cũ bằng hệ lan can, thoát nước mới.
Chất lượng thi công hạng mục sửa chữa phần cầu chính của cầu Ngòi Thủ thuộc gói thầu sửa chữa, khắc phục sự cố cầu Ngòi Thủ (Km136+108), đường cao tốc Nội Bài - Lào Cai tuân thủ theo yêu cầu kỹ thuật, tiêu chuẩn thi công và nghiệm thu của Dự án, được tư vấn giám sát chấp thuận. Các hạng mục công trình đã được nghiệm thu đảm bảo so với yêu cầu thiết kế. Bắt đầu từ 16h ngày 30.6.2019, VEC chính thức thông xe cầu Ngòi Thủ.