Theo đó, tuyến Hà Nội-Vinh tạm dừng chạy đôi tàu SE35/SE36, thường xuyên chạy đôi tàu NA1/NA2. NA1 chạy tại Hà Nội lúc 22h45 đến Vinh lúc 5h16. NA2 chạy tại Vinh lúc 22h5 đến Hà Nội lúc 5h10.
Tuyến Hà Nội-Lào Cai tạm dừng chạy tàu SP1/SP2, thường xuyên chạy đôi tàu SP3/SP4. SP3 chạy tại Hà Nội lúc 22h đến Lào Cai 6h5. SP4 chạy tại Lào Cai lúc 21h40 đến Hà Nội 5h30.
Ngoài ra, các mác tàu YB3 chạy các ngày thứ Bảy và YB4 các ngày Chủ nhật hàng tuần. YB3 chạy tại Hà Nội lúc 6h10 đến Yên Bái 10h50. YB4 chạy tại Yên Bái 14h45 đến Hà Nội 19h20. Hiện Công ty cổ phần Vận tải đường sắt Hà Nội hoàn trả toàn bộ tiền vé (không thu phí trả vé) đối với hành khách đã mua vé tàu SE35/SE36, YB3/YB4.
Theo thống kê của Tổng công ty Đường sắt Việt Nam (VNR), chỉ trong vòng chưa đến 20 ngày, vận tải đường sắt giảm hơn 60 tỉ đồng doanh thu do dịch bệnh viêm đường hô hấp cấp COVID-19 (nCoV). Tính đến ngày 14.2.2020, lượng hành khách trả lại vé đã mua tăng đột biến (39.263 vé, tương ứng 160,5%). Đại diện VNR cho biết với tình hình dịch bệnh hiện nay sẽ khiến các chỉ tiêu sản xuất, kinh doanh của đường sắt chắc chắn sụt giảm, bị ảnh hưởng tối thiểu khoảng 20% nên cần sớm từng bước kiểm soát dịch tốt để hoạt động vận tải trở lại bình thường, tuy nhiên cũng phải mất thêm một thời gian nữa mới có thể khôi phục lại.
Hiện các công ty cổ phần vận tải đường sắt phải hủy 78 chuyến tàu khách, tương ứng giảm 8,3% so với kế hoạch. Doanh thu vận tải hành khách dự kiến giảm 54,8 tỉ đồng, tương ứng giảm 13,3% so với cùng kỳ. Doanh thu vận tải hàng hóa dự kiến giảm thêm 9,9 tỉ đồng.
Nguyên nhân được phía VNR đưa ra là do việc thực hiện hàng loạt biện pháp đồng bộ, kiên quyết để phòng ngừa dịch bệnh lây lan, hạn chế tổ chức lễ hội, du lịch, lùi thời gian nhập học của học sinh, sinh viên, dẫn đến lượng khách đi tàu sụt giảm mạnh. Ngành đường sắt phải bãi bỏ tàu, kết thúc sớm đợt vận tải Tết Nguyên đán so với kế hoạch. Tàu khách liên vận quốc tế Hà Nội-Nam Ninh cũng ngừng chạy tàu từ ngày 5.2.2020.
