Sáng 16.9, ở khu vực Bắc Trung Bộ tiếp tục có mưa rào và dông, cục bộ có mưa to với lượng mưa từ 15-30mm, có nơi trên 60mm. Chiều tối và tối ngày 16.9 ở khu vực Trung Trung Bộ, Tây Nguyên và Nam Bộ có mưa rào và dông, cục bộ có mưa to với lượng mưa từ 20-40mm, có nơi trên 70mm.
Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc, sét và gió giật mạnh. Mưa lớn cục bộ có khả năng gây ra tình trạng ngập úng tại các vùng trũng, thấp và nguy cơ xảy ra lũ quét, sạt lở đất tại khu vực vùng núi.
Ngày và đêm 16.9, ở vịnh Bắc Bộ, khu vực Bắc Biển Đông (bao gồm vùng biển quần đảo Hoàng Sa), vùng biển Cà Mau đến Kiên Giang và vịnh Thái Lan có mưa rào và dông. Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc xoáy và gió giật mạnh cấp 7-8.
Cũng theo Ban chỉ đạo quốc gia về phòng, chống thiên tai mưa từ 19h ngày 14.9 đến 19h ngày 15.9 các khu vực trên cả nước có mưa vừa, mưa to, có nơi mưa rất to, lượng mưa phổ biến từ 50-90mm, một số trạm có lượng mưa lớn hơn như: Cúc Phương (Ninh Bình) 192mm; An Bình (Hoà Bình) 98mm; Kim Tân (Thanh Hoá) 171mm; Thuỷ Điện Rào Trăng 4 (Thừa Thiên Huế) 123mm; Sơn Bua (Quảng Ngãi) 129mm.
Từ 19h ngày 15.9 đến 7h ngày 16.9 khu vực Trung Bộ và Tây Nguyên có mưa vừa đến mưa to, lượng mưa phổ biến từ 20-50mm, một số trạm có lượng mưa lớn hơn như: Yên Thành (Nghệ An) 85mm; Quỳnh Lưu (Nghệ An) 71mm; Hải An (Quảng Trị) 70mm; Bình An (Quảng Ngãi) 54mm.
Từ 19h ngày 12.9 đến 19h ngày 15.9 các khu vực trên cả nước có mưa, mưa to, tổng lượng mưa phổ biến từ 60-120mm, một số trạm có tổng lượng mưa lớn hơn như: Cửa Ông (Quảng Ninh) 196mm; Hiệp Hoà (Bắc Giang) 142mm; Cúc Phương (Ninh Bình) 195mm; Kim Tân (Thanh Hoá) 171mm; Ia Tơi (Kon Tum) 131mm, Sơn Bua (Quảng Ngãi) 130mm.
Về tình hình thủy văn, các sông khu vực Bắc Bộ, mực nước sông Hồng tại Hà Nội và mực nước sông Thái Bình tại Phả Lại biến đổi chậm và chịu ảnh hưởng của thuỷ triều. Lúc 7h ngày 16.9 mực nước trên sông Hồng tại trạm Hà Nội là 2,50m; trên sông Thái Bình tại Phả Lại là 1,42m.
Dự báo đến 7h ngày 17.9 mực nước tại trạm Hà Nội có khả năng ở mức 2,3m; trong 36 giờ tới, mực nước tại Phả Lại cao nhất có khả năng ở mức 2,1m và thấp nhất ở mức 1,3m.
Các sông khu vực Trung Bộ, mực nước các sông ở Trung Bộ biến đổi chậm, mực nước hạ lưu các sông dao động theo thủy triều và điều tiết hồ chứa.
Các sông Nam Bộ mực nước lúc 7h ngày 16.9 tại trạm Kratie (sông Mê Công) ở mức 19,49m cao hơn trung bình cùng kỳ 0,71m, nhỏ hơn mực nước lớn nhất cùng kỳ 3,09m.
Mực nước đầu nguồn sông Cửu Long đang lên theo triều, mực nước cao nhất ngày 15.9 trên sông Tiền tại Tân Châu là 2,31m; trên sông Hậu tại Châu Đốc là 2,24m.
Dự báo mực nước đầu nguồn sông Cửu Long tiếp tục lên theo triều. Đến ngày 19.9, mực nước cao nhất ngày tại Tân Châu ở mức 2,5m và tại Châu Đốc ở mức 2,35m.
