Ngày 27.3.2015, UBND tỉnh Phú Yên có Thông báo số 200 về việc chuyển đổi mục đích sử dụng đất rừng phòng hộ khu vực An Phú thuộc dự án Khu du lịch liên hợp cao cấp New City như sau: “… không đặt lại vấn đề trình Thủ tướng Chính phủ chuyển mục đích đất rừng phòng hộ. Nhằm tạo điều kiện cho chủ đầu tư… cho phép thực hiện việc phân kỳ thu hồi đất rừng phòng hộ với diện tích đất thu hồi từng đợt nhỏ hơn 20ha” - thực chất là chia nhỏ để không phải xin phép Thủ tướng Chính phủ theo quy định..."
Đến thời điểm Thanh tra Chính phủ kiểm tra, khu đất tại An Phú chưa có quyết định cho thuê đất của cơ quan có thẩm quyền và chưa bàn giao đất cho nhà đầu tư.
Thực tế, nhà đầu tư đã triển khai san lấp, trồng cỏ một phần diện tích của dự án. Dự án cũng chưa được Bộ TNMT phê duyệt báo cáo đánh giá tác động môi trường.
Theo Thanh tra Chính phủ, diện tích rừng thực tế bị chặt phá để tiến hành xây dựng sân golf, khách sạn, resort là 40ha, trong đó Công ty TNHH New City VN tự ý khai thác 2,7ha, UBND tỉnh cho phép khai thác không đúng quy định là 37,3ha.
Quá trình triển khai dự án cũng có nhiều sai phạm. Theo đó, việc UBND tỉnh cho phép Công ty TNHH New City Việt Nam khai thác 5ha rừng để làm lễ động thổ và chỉ đạo Sở NNPTNT tổ chức thẩm định, phê duyệt hồ sơ thiết kế và cấp giấy phép khai thác với diện tích 64,12ha khi chưa được Thủ tướng Chính phủ cho phép chuyển mục đích sử dụng rừng là vi phạm Điều 11, Thông tư 35 (ngày 20.5.2011) của Bộ NNPTNT.
Việc cho phép vừa triển khai xây dựng vừa hoàn tất các thủ tục khi chưa được Bộ TNMT phê duyệt Báo cáo đánh giá tác động môi trường, chưa có quyết định cho thuê đất cũng như bàn giao đất trên thực địa, chưa có hồ sơ thiết kế cơ sở, thiết kế kỹ thuật thi công và quy hoạch chi tiết 1/500 được phê duyệt, chưa được cấp phép xây dựng là vi phạm các quy định của pháp luật.
Dự án Khu du lịch liên hợp cao cấp New City Việt Nam trước đây là dự án Khu du lịch liên hợp cao cấp Phú Yên (100% vốn nước ngoài) được Thủ tướng Chính phủ đồng ý về nguyên tắc vào tháng 8.2004.
Dự án sau khi được UBND tỉnh cấp giấy chứng nhận đầu tư lần đầu và giấy chứng nhận đầu tư điều chỉnh lần 1 được đổi tên thành dự án Khu du lịch liên hợp cao cấp New City Việt Nam với quy mô 357,52ha. Trong đó, khu vực An Phú 122,52ha (đang triển khai thực hiện, với diện tích 122,04ha), khu vực Bãi Súng 235ha (chưa thực hiện).
