Theo danh sách đăng kí ban đầu, đoàn thể thao Indonesia đăng kí 541 vận động viên dự SEA Games 31 tại Việt Nam. Tuy nhiên, sau khi xem xét và cân nhắc, quốc gia này quyết định cắt giảm số lượng xuống còn 508 vận động viên (315 nam, 193 nữ).
Theo tờ Indosport, Bộ Thanh niên và Thể thao Indonesia có lý do để làm điều này. Theo đó, họ đã phân tích khả năng giành huy chương của các vận động viên trước khi chốt danh sách cuối cùng tham dự SEA Games 31.
Ông Mochamad Asnawi - Trưởng nhóm đánh giá cải thiện thành tích thể thao quốc gia (PPON) cho biết, dữ liệu được phân tích là thành tích của các vận động viên trong các kì Đại hội trước đó cũng như một số giải đấu khu vực và quốc tế mà họ tham dự, trong khoảng thời gian từ năm 2019 đến 2021.
Theo số liệu thống kê, tại SEA Games 30 năm 2019 (Philippines), Indonesia đã bị hao hụt ngân sách do không cân đối được giữa số lượng vận động viên tham dự với số lượng huy chương giành được tại giải đấu. Điều này bắt nguồn từ việc không phân tích, xét duyệt về khả năng đạt thành tích của các vận động viên.
Chính vì thế, Bộ Thanh niên và Thể thao Indonesia quyết định cắt giảm số lượng vận động viên đáng kể để tăng hiệu quả trong việc giành huy chương tại Đại hội Thể thao Đông Nam Á lần thứ 31.
Trong đó, đoàn thể thao Indonesia đã rút khỏi nội dung bóng ném bãi biển, khiến ban tổ chức nước chủ nhà buộc phải huỷ môn thi đấu này trong hệ thống thi đấu tại SEA Games 31 do không đủ số đội tham dự theo quy định (chỉ còn Việt Nam và Thái Lan).
Mục tiêu của đoàn thể thao Indonesia là lọt vào Top 4 quốc gia dẫn đầu tại SEA Games 31.