Lượng cá tra giống sản xuất tại tỉnh Đồng Tháp trong 3 tháng đầu năm 2018 (164 triệu con) đáp ứng nhu cầu thả nuôi mới của tỉnh, song đối với toàn vùng ĐBSCL thì có hiện tượng thiếu con giống. Ấy nhưng, điều đáng quan ngại không chỉ là tình hình cung không đủ cầu mà chính là chất lượng con giống. Tuy trình độ sản xuất cá tra giống của người dân đã được nâng cao từ sự hỗ trợ tích cực của các chương trình khuyến nông của nhà nước và kể cả của tư nhân, nhưng thời tiết diễn biến thất thường nên việc sản xuất, dưỡng con giống thời gian qua đối mặt với nhiều khó khăn khiến tỉ lệ sống thấp, mắc bệnh nhiều… dẫn đến người sản xuất sử dụng nhiều hóa chất, kháng sinh để phòng, trị bệnh làm ảnh hưởng đến chất lượng con giống.
Tuy nhiên, thực tế cho thấy, thời tiết diễn biến thất thường không phải là yếu tố duy nhất ảnh hưởng đến chất lượng con giống, mà còn xuất phát từ những nguyên nhân khác rất đáng quan tâm. Cụ thể như: Cũng theo ngành NNPTNT Đồng Tháp, thời gian qua, mối liên kết giữa các cơ sở sản xuất con giống, hộ nuôi và doanh nghiệp nuôi cá tra chưa chặt chẽ, thống nhất và hài hòa lợi ích giữa các bên. Đa số doanh nghiệp - kể cả doanh nghiệp có vùng nuôi lớn - chưa chú trọng đầu tư khép kín sản xuất con giống cho vùng nuôi, mà hầu hết đều chọn phương thức mua thu gom từ các hộ sản xuất giống cá tra nhỏ lẻ. Còn các tổ hợp tác sản xuất con giống dù đã được thành lập, song mang tính hình thức, hoạt động chưa thật sự hiệu quả. Đã vậy, còn diễn ra tình trạng cạnh tranh thiếu lành mạnh giữa các cơ sở sản xuất con giống (cho cá sinh sản nhiều lần trong năm…).
Ai cũng biết trong sản xuất nông nghiệp (cây trồng - vật nuôi), giống là một trong những yếu tố quan trọng góp phần đáng kể vào việc nâng cao hiệu quả sản xuất, tác động không nhỏ tới sự thành công hay thất bại. Vì vậy, đối với con cá tra - vật nuôi thủy sản chủ lực của vùng ĐBSCL cùng với con tôm - không thể không triển khai các giải pháp để nâng cao chất lượng con giống; trong đó bao gồm cả giải pháp kỹ thuật, giải pháp quản lý và chính sách hỗ trợ để tiến tới xây dựng thương hiệu cá tra giống chất lượng cao trên nền tảng chất lượng…
