Theo cáo trạng, quá trình điều tra, Trương Xuân Đước và vợ là Nguyễn Thị Ngọc Anh khai: Đước quản lý, điều hành các công ty hoạt động mua bán trái phép hóa đơn từ năm 2005, còn Ngọc Anh tham gia quản lý, điều hành các công ty cùng với Đước từ năm 2007 đến năm 2022 thì ngừng hoạt động.
Tổng cộng, thông qua 26 công ty, Đước đã chỉ đạo mua bán trái phép 21.449 hóa đơn. Tuy nhiên, số hóa đơn mua bán trái phép mà Trương Xuân Đước và Nguyễn Thị Ngọc Anh phải chịu trách nhiệm hình sự là 15.674 hóa đơn. Lý do: số hóa đơn còn lại được mua bán trái phép trong thời gian từ tháng 2.2013 trở về trước và đã hết thời hiệu truy cứu trách nhiệm hình sự do việc mua bán trái phép hóa đơn trong thời gian dài không bị phát hiện, xử lý. Theo Khoản 2 Điều 27 Bộ luật Hình sự, tội mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách nhà nước là tội phạm nghiêm trọng và thời hiệu truy cứu trách nhiệm hình sự là 10 năm đối với tội phạm nghiêm trọng.
Vì vậy, đến thời điểm Đước và Ngọc Anh bị khởi tố thì đã hết thời hiệu truy cứu trách nhiệm hình sự đối với các hóa đơn được mua bán trái phép trong thời gian từ tháng 2.2013 trở về trước.
Tổng giá trị của 15.674 hóa đơn phải chịu trách nhiệm hình sự trong khoảng thời gian từ tháng 3.2013 đến tháng 5.2022 tại địa bàn Hải Phòng, Hà Nội, Hải Dương, Quảng Ninh là hơn 6.000 tỉ đồng (chưa tính V.A.T).
Về số tiền thu lời bất chính từ hoạt động mua bán trái phép hóa đơn, Đước và Ngọc Anh khai: giá bán hóa đơn không cố định, lên xuống tùy từng thời điểm nhưng luôn bán ra với giá cao hơn so với mua vào là 1% giá trị hàng hóa dịch vụ ghi trên hóa đơn (chưa tính thuế VAT). Số tiền 1% Đước và Ngọc Anh thụ được khi bán hóa đơn trái phép là hơn 60 tỉ đồng. Sau khi trừ các chi phí như: thuê nhà làm trụ sở, thuê kế toán... và các chi phí khác, Đước và Ngọc Anh thu lời được số tiền là hơn 41 tỉ đồng.
Liên quan đến vụ mua bán hóa đơn trái phép rất lớn này của Trương Xuân Đước và vợ là Nguyễn Thị Ngọc Anh còn có nhiều cá nhân khác, trong đó có cựu Giám đốc Công an Hải Phòng Đỗ Hữu Ca. Theo điều tra, ông Ca đã 4 lần nhận tiền của Đước với tổng số tiền 35 tỉ đồng để giúp “chạy án” nhưng không thực hiện như đã cam kết với Đước. Trong quá trình điều tra, Đỗ Hữu Ca đã nộp lại cho cơ quan chức năng 35 tỉ đồng.
Với những tội danh mà các bị cáo đã khai nhận cũng như trong thực tế điều tra, Viện Kiểm sát Nhân dân tỉnh Quảng Ninh quyết định truy tố các bị can Trương Xuân Đước, Nguyễn Thị Ngọc Anh về các tội: “Mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách nhà nước”, và tội “ Đưa hối lộ”, được quy định tại các điểm: b, d, đ,e khoản 2 Điều 203 và khoản 4, Điều 364 Bộ luật Hình sự.
Cựu Giám đốc Công an Hải Phòng Đỗ Hữu Ca bị truy tố về tội: “Lừa đảo chiếm đoạt tài sản” được quy định tại điểm a khoản 4 Điều 174 Bộ luật Hình sự.
Các bị can Nguyễn Đình Đương - cựu Chi cục trưởng Chi cục Thuế huyện Cát Hải, TP.Hải Phòng và Đỗ Thanh Hoài - nguyên cán bộ Chi cục Thuế huyện Cát Hải - bị truy tố về tội: “ Nhận hối lộ”, được quy định tại các điểm c, đ khoản 2 Điều 354 Bộ luật Hình sự. Theo cáo trạng, 2 bị can này đã nhận tiền hối lộ của Đước và Ngọc Anh với tổng cộng 362 triệu đồng.
