Theo kết luận điều tra, cuối năm 2012, Công ty cổ phần phát triển đầu tư Thái Sơn Bộ Q.P ký hợp đồng hợp tác kinh doanh (thực chất là thuê đất) của Lữ đoàn 434, Quân đoàn 4 để cho Công ty TNHH vận tải thủy bộ Hải Hà thuê lại kinh doanh xăng dầu.
Đinh Ngọc Hệ đã ký quyết định thành lập chi nhánh Công ty cổ phần phát triển đầu tư Thái Sơn Bộ Q.P tại Bình Dương và bổ nhiệm ông Trần Xuân Sơn (người của Công ty Hải Hà) làm Giám đốc chi nhánh.
Chi nhánh này chỉ là danh nghĩa đứng tên Công ty cổ phần phát triển đầu tư Thái Sơn Bộ Q.P, thực chất là để xin cấp phép xây dựng, giấy phép kinh doanh xăng dầu giúp Công ty Hải Hà mà không liên quan đến nhiệm vụ kinh tế quốc phòng.
Sau khi được cơ quan chức năng cấp phép, Công ty Hải Hà đầu tư cơ sở vật chất, mở cửa hàng xăng dầu Thái Sơn.
Ngày 23.6.2014, Đội kiểm tra liên ngành của tỉnh Bình Dương kiểm tra của hàng xăng dầu Thái Sơn, lập biên bản về việc thiếu giấy chứng nhận đo lường cột bơm, thiếu hợp đồng đại lý bán lẻ xăng dầu và lấy mẫu kiểm tra chất lượng.
Ngày 2.7.2014, Đội kiểm tra liên ngành thông báo 20.348 lít xăng A92 còn trong bồn khi thu mẫu ngày 23.6.2014 không đạt tiêu chuẩn chất lượng nên đã niêm phong cột bơm và yêu cầu doanh nghiệp cung cấp tài liệu giải trình.
Sau khi được báo cáo vụ việc, Đinh Ngọc Hệ đã chỉ đạo Trần Văn Lâm làm văn bản gửi ông Lê Thanh Cung, lúc đó là Chủ tịch UBND tỉnh Bình Dương mạo nhận hoạt động kinh doanh xăng dầu của cửa hàng xăng dầu Thái Sơn (chủ yếu phục vụ nhiệm vụ kinh tế quốc phòng) để xin không bị xử phạt.
Đồng thời, Đinh Ngọc Hệ gọi điện cho đại tá Bùi Văn Tiệp, lúc đó là Sư đoàn trưởng Sư đoàn 367, Quân chủng Phòng không Không quân để Trần Văn Lâm gặp, trao đổi, thực hiện việc ký hợp đồng giả, nhận số xăng kém chất lượng trên là của Sư đoàn 367 gửi, không phải là xăng kinh doanh để trốn tránh việc xử phạt.
Căn cứ chứng từ tài liệu do Trần Văn Lâm, Trần Xuân Sơn cung cấp và ý kiến của ông Lê Thanh Cung (nguyên Chủ tịch UBND tỉnh), Chi cục quản lý thị trường tỉnh Bình Dương tin tưởng đây là xăng dầu của đơn vị Quân đội gửi nên không truy xuất đến cùng, không xử phạt hành chính đối với số xăng kém chất lượng nêu trên.
Để có căn cứ xử lý trách nhiệm của các đối tượng trong vụ án, theo yêu cầu của cơ quan điều tra, Chi cục Quản lý thị trường, Sở Công Thương tỉnh Bình Dương và Cục quản lý thị trường, Bộ Công Thương đã xác định mức phạt đối với sai phạm của Chi nhánh Thái Sơn tại Bình Dương trong việc kinh doanh xăng kém chất lượng nêu trên là gần 1,5 tỉ đồng.
Quá trình điều tra, bị can Đinh Ngọc Hệ không thừa nhận việc chỉ đạo Trần Văn Lâm gặp Đại tá Bùi Văn Tiệp để làm thủ tục hợp đồng, hợp thức nguồn gốc xăng dầu kém chất lượng.
Hệ cũng không thừa nhận việc nhờ vả ông Lê Thanh Cung giúp đỡ để không bị xử phạt. Vì vậy, Cơ quan điều tra đã tổ chức đối chất giữa bị can Bùi Văn Tiệp, Trần Văn Lâm với bị can Hệ để xác định rõ vai trò của Đinh Ngọc Hệ trong vụ án.
Kết quả đối chất, Bùi Văn Tiệp, Trần Văn Lâm tiếp tục khẳng định bị can Hệ là người đã liên lạc với Bùi Văn Tiệp, đã chỉ đạo hợp thức số xăng kém chất lượng nêu trên.
Mặc dù, bị can Hệ không thừa nhận hành vi phạm tội nhưng với tài liệu chứng cứ thu thập được có đủ cơ sở khẳng định: Đinh Ngọc Hệ đã chỉ đạo cấp dưới lợi dụng danh nghĩa là doanh nghiệp quân đội là kinh tế quốc phòng, báo cáo sai sự thật với UBND và các cơ quan chức năng tỉnh Bình Dương.
Mục đích của Đinh Ngọc Hệ là làm giả hợp đồng, hợp thức hóa nguồn gốc xăng kém chất lượng, nhằm tránh bị xử phạt. Hành vi này đã gây thất thu cho Ngân sách nhà nước gần 1,5 tỉ đồng, ảnh hưởng nghiêm trọng đến uy tín của Quân đội, có đủ yếu tố cấu thành tội: “Lợi dụng chức vụ quyền hạn trong khi thi hành công vụ”.
Tuy không thừa nhận hành vi phạm tội nhưng ngày 20.6.2018, Đinh Ngọc Hệ đã có đơn đề nghị tự nguyện chia sẻ khắc phục hậu quả và gia đình bị can đã nộp số tiền 500 triệu đồng.
