Quá trình điều tra xác minh, từ cuối năm 2015 đến nay, Lê Thị Thu đứng ra thành lập Cty TNHH xây dựng và vận tải Trường Tồn, sử dụng chứng minh nhân dân của 4 người có hộ khẩu thường trú tại Hoành Bồ gồm: Nguyễn Văn Long (sinh năm 1983); Hồ Sỹ Thoại (sinh năm 1986); Nguyễn Thu Quỳnh (sinh năm 1987); Trần Thị Hiền (sinh năm 1982) để lần lượt thay đổi đứng tên giám đốc Cty Trường Tồn.
Thu ký giả chữ ký các giám đốc nêu trên ký hàng loạt chứng từ hóa đơn để thực hiện mua trái phép 126 hóa đơn giá trị gia tăng với tổng trị giá hàng trên 55 tỷ đồng cho 5 Cty có địa chỉ tại thành phố Hải Phòng.
Cũng vẫn hành vi trên, Thu bán trái phép 393 số hóa đơn giá trị gia tăng Cty Trường Tồn cho trên 70 đơn vị sử dụng ở trong và ngoài tỉnh Quảng Ninh với số tiền thu lợi trên 2 tỉ đồng. Vụ việc được Công an Quảng Ninh khởi tố và xem xét điều tra mở rộng trước pháp luật.