Theo đó, phiên xét xử bị cáo Diệp Dũng được thực hiện theo hình thức xử kín.
Ngoài bị cáo Diệp Dũng, còn có 2 bị cáo bị buộc vai trò chính trong vụ án, là Lê Thị Phương Hồng (43 tuổi, kinh doanh tự do) và Nguyễn Hoài Bắc (38 tuổi, cựu cán bộ Phòng An ninh Kinh tế Công an TPHCM) bị truy tố về tội Cố ý làm lộ bí mật Nhà nước.
Theo cáo trạng, Nguyễn Hoài Bắc được phân công làm thành viên tổ công tác kiểm tra, xác minh các sai phạm xảy ra tại Saigon Co.op. Ông Bắc đã mang theo các tài liệu có nội dung liên quan đến quá trình xác minh, thu thập tài liệu vụ việc xảy ra tại Saigon Co.op về nhà, nơi ông Bắc và bà Hồng có quan hệ tình cảm và sống chung như vợ chồng.
Ngoài ra, ông Bắc còn thường xuyên nhắn tin, trao đổi và cung cấp thông tin liên quan đến quá trình điều tra, xác minh nguồn tin về tội phạm xảy ra tại Saigon Co.op cho Hồng biết. Từ thông tin của ông Bắc, bà Hồng đã điện thoại, nhắn tin, cung cấp cho ông Diệp Dũng (ông Diệp Dũng là người chịu trách nhiệm chính trong các sai phạm xảy ra tại Saigon Co.op mà Cơ quan điều tra đang thụ lý xác minh).
Tháng 9.2020, bà Hồng chủ động liên hệ với ông Dũng làm quen và gửi một số thông tin quan trọng liên quan đến ông Dũng bị điều tra sai phạm tại Saigon Co.op. Sau thời gian liên lạc qua lại, ông Dũng gặp bà Hồng. Tại buổi gặp, bà Hồng và ông Dũng trao đổi nội dung liên quan sai phạm của ông Dũng dẫn đến việc Saigon Co.op bị truy thu thuế.
Sau đó, ông Diệp Dũng nhờ tài xế của mình gặp bà Hồng và đưa phong bì. Khi về nhà bà Hồng mở ra có lá thư và 100 triệu đồng.
Cáo trạng xác định, bà Hồng đã cung cấp cho ông Dũng một số thông tin chứa tài liệu mật là kết quả xác minh vụ Saigon Co.op. Kết quả điều tra, thu giữ được các tin nhắn từ điện thoại của bà Hồng phù hợp nội dung tin nhắn thu giữ từ điện thoại của ông Dũng. Thể hiện việc ông Diệp Dũng tiếp nhận thông tin từ bà Hồng, bà Hồng thu thập thông tin, tài liệu báo lại cho ông Dũng biết.
Cũng theo cáo trạng, nội dung bà Hồng cung cấp cho ông Dũng có liên quan đến kết quả điều tra, định hướng điều tra, phương hướng đấu tranh với những người liên quan khi Cơ quan điều tra triệu tập làm việc thu thập tài liệu, chứng cứ và tiến trình giải quyết vụ việc tại Saigon Co.op, là những thông tin thuộc chế độ “Mật”. Do đó, hành vi của ông Diệp Dũng đã cấu thành tội “Chiếm đoạt tài liệu bí mật Nhà nước”.
Ngày 16.12.2020, Cơ quan An ninh điều tra Công an TP.HCM tống đạt quyết định khởi tố bị can, bắt tạm giam ông Diệp Dũng, cựu Chủ tịch HĐQT Liên hiệp Hợp tác xã Thương mại TP (Saigon Co.op) về tội Lạm quyền trong khi thi hành công vụ.
Đến ngày 19.3.2021, ông Dũng tiếp tục bị khởi tố về tội Chiếm đoạt tài liệu, bí mật Nhà nước
Liên quan tới ông Diệp Dũng, vào ngày 26.4.2022, Ban Bí thư đã quyết định khai trừ ra khỏi Đảng đối với ông Diệp Dũng, nguyên Thành ủy viên, nguyên Bí thư Đảng ủy, nguyên Chủ tịch HĐQT Saigon Co.op.
