Trong bản kết luận điều tra, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công đã đề nghị truy tố ông Trần Văn Minh (cựu Chủ tịch UBND TP. Đà Nẵng) và 20 bị can về hai tội Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước, gây thất thoát, lãng phí. theo Điều 219, Bộ Luật hình sự 2015 và Vi phạm các quy định về quản lý đất đai, theo Điều 229, Bộ luật Hình sự 2015.
Ông Trần Văn Minh được xác định là chủ mưu, cầm đầu, thực hiện một loạt sai phạm khi giao đất công sản cho Phan Văn Anh Vũ (Vũ "Nhôm", Chủ tịch HĐQT Công ty CP xây dựng Bắc Nam 79) với giá rẻ, không qua đấu giá...
Theo kết luận, thời kỳ ông Minh làm Chủ tịch UBND TP. Đà Nẵng (2006-2011), Vũ "Nhôm" đã đứng tên, nhờ người thân thành lập, tham gia góp vốn và trực tiếp điều hành - hoạt động của 5 doanh nghiệp kinh doanh bất động sản. Cựu Chủ tịch này nắm được mục đích của Vũ "Nhôm" muốn thâu tóm nhiều dự án bất động sản và nhà, đất công sản trên địa bàn TP. Đà Nẵng.
Ông Minh đã cùng với Vũ "Nhôm" bàn bạc, ra các văn bản pháp lý sai phạm để giúp nhanh chóng hoàn thiện hồ sơ, thủ tục nhận chuyển nhượng, không qua đấu giá, mua với giá thấp hơn quy định của Đà Nẵng.
Sau đó, ông Minh đã ký ban hành nhiều văn bản và chỉ đạo cấp dưới thực hiện việc giao đất, thu hồi, cho thuê, cho phép chuyển quyền sử dụng đất, mục đích sử dụng đất và chuyển nhượng nhà, đất công sản trên địa bàn thành phố Đà Nẵng cho Vũ "Nhôm".
Ông này còn đưa ra quyết định giảm giá, giảm hệ số sinh lợi không thông qua Hội đồng thẩm định giá đất TP. Đà Nẵng, cho phép chuyển đổi tên người nhận quyền sử dụng đất trái quy định của pháp luật.
Tại một số dự án bất động sản, ông Minh đã chỉ đạo cấp dưới xây dựng các văn bản pháp lý, nhanh chóng hoàn thành hồ sơ, thủ tục để giúp Vũ "Nhôm" nhận chuyển nhượng các dự án này không qua đấu giá, với giá thấp hơn giá UBND TP. Đà Nẵng quy định.
Ngay cả khi biết Vũ "Nhôm" nhờ giám đốc một số công ty được chỉ định mua nhà, đất công sản, làm bình phong mua cho mình, ông Minh "làm ngơ". Ông Minh còn biết, Vũ đứng ra trả tiền thay các công ty này để sau này đứng tên trong Giấy chứng nhận quyền sử dụng đất. Vì vậy, khi các công ty đề nghị được thay đổi người trong giấy chứng nhận quyền sử dụng đất là Vũ "Nhôm", ông Minh đã đồng ý.
Với sai phạm của ông Minh, 18 nhà, đất công sản và 7 dự án đất, đã bị Vũ "Nhôm" thâu tóm. Hành vi của cựu chủ tịch này đã gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước là hơn 22.000 tỉ đồng (tính tại thời điểm khởi tố vụ án).
Sai phạm của ông Minh có sự giúp sức của ông Văn Hữu Chiến, khi là Phó Chủ tịch UBND thành phố Đà Nẵng (giai đoạn 2006-2011), dưới quyền. Theo chỉ đạo của ông Minh, ông Chiến cũng đã ký, ban hành nhiều quyết định cho phép chuyển nhượng và phê duyệt giá chuyển nhượng nhà, đất công sản và dự án bất động sản trái quy định.
Khi giữ chức chủ tịch UBND TP. Đà Nẵng (2011-2014), ông Chiến tiếp tục ký nhiều văn bản chỉ đạo cấp dưới cho phép chuyển nhượng và phê duyệt giá với hai nhà đất công sản tại số 16 Bạch Đằng và 121 Phan Châu Trinh trái quy định cho Vũ "Nhôm". Sai phạm của ông Chiến qua hai thời kỳ làm lãnh đạo UBND TP. Đà Nẵng, đã gây thiệt hại cho Nhà nước là gần 14.000 tỉ đồng (tính tại thời điểm khởi tố vụ án).
Liên quan đến vụ án, cơ quan điều tra thu giữ của ông Minh 5 khẩu súng là công cụ hỗ trợ và đồ chơi nguy hiểm, 18 viên đạn. 37 tài sản đất tại Đà Nẵng của Vũ "Nhôm" cũng bị kê biên.