Công đoàn (CĐ) cơ quan BHXH Việt Nam là CĐ cấp trên cơ sở, hiện đang quản lý 28 CĐ trực thuộc bao gồm 9 CĐ cơ sở và 19 CĐ bộ phận. Tổng số đoàn viên CĐ là 703 người, trong đó 660 người (91,6%) có trình độ đại học trở lên, đoàn viên CĐ nữ là 377 người, chiếm 53,6% tổng số đoàn viên CĐ.
Trong năm 2017, CĐ các cấp đã đề nghị chính quyền nâng lương, chuyển xếp lương định kỳ cho 75 công chức viên chức (CCVC); nâng lương trước thời hạn cho 28 CCVC có thành tích xuất sắc trong thực hiện nhiệm vụ; tham gia ý kiến vào công tác bổ nhiệm cán bộ quản lý cho 76 CCVC được bổ nhiệm mới và bổ nhiệm lại là 13; thường xuyên quan tâm chăm lo đến đời sống, vật chất, tinh thần của các đoàn viên, góp phần bảo đảm đời sống CCVC trong và sau Tết Nguyên đán 2017...
Trong năm 2017, CĐ cơ quan đã tích cực vận động đông đảo cán bộ, đoàn viên tham gia các hoạt động xã hội từ thiện. Theo đó, đóng góp 1 ngày lương cơ sở hỗ trợ mua thẻ BHYT cho người dân có hoàn cảnh khó khăn với số tiền 550 triệu đồng; hỗ trợ đồng bào tỉnh Tây Bắc bị lũ lụt, thiên tai số tiền là 1 tỉ đồng; hỗ trợ đồng bào miền Trung bị thiệt hại do cơn bão số 12 là 200 triệu đồng; ủng hộ Quỹ đền ơn đáp nghĩa 30 triệu đồng; ủng hộ kinh phí xây dựng Trường Sa là 30 triệu đồng… Tổng số tiền là hơn 3,5 tỉ đồng.
Ghi nhận những kết quả đạt được trong thời gian qua, CĐ cơ quan BHXH Việt Nam đã được Tổng LĐLĐVN trao tặng Cờ Thi đua, 1 cá nhân được nhận Bằng khen của Tổng LĐLĐVN; 5 tập thể và 10 cá nhân được nhận bằng khen của CĐ Viên chức Việt Nam; 26 tập thể và 196 cá nhân được CĐ cơ quan BHXH Việt Nam tặng Giấy khen; 13 CĐ trực thuộc và 30 tổ CĐ được công nhận Tổ CĐ xuất sắc; 246 cá nhân đạt đoàn viên CĐ xuất sắc. Đặc biệt, trong năm 2017, CĐ cơ quan BHXH Việt Nam có 1 cá nhân điển hình về tấm gương “Người tốt, việc tốt” được Tổng LĐLĐVN đề cử vào danh sách 100 đại biểu tiêu biểu toàn quốc trong phong trào hiến máu tình nguyện năm 2017, được tặng Bằng khen và Cúp lưu niệm của Bộ Trưởng Bộ Y tế.