Thấm nhuần lời dạy của Chủ tịch Hồ Chí Minh: “Thi đua là yêu nước, yêu nước thì phải thi đua và những người thi đua là những người yêu nước nhất”, phong trào thi đua của Công đoàn Bộ Tư lệnh được tổ chức thường xuyên với nhiều nội dung, hình thức phong phú, đa dạng, thiết thực và hiệu quả như:
Phong trào Lao động giỏi, năng suất, chất lượng hiệu quả; Năm nhất, ba không; Lao động giỏi, lao động sáng tạo; An toàn lao động, an toàn giao thông, không vi phạm kỷ luật; Thực hành tiết kiệm, chống tham ô lãng phí… gắn với việc học tập, làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh.

Tháng An toàn vệ sinh lao động, Tháng Công nhân được tổ chức thường xuyên, có hiệu quả thiết thực. Duy trì và tổ chức luyện tập phòng cháy chữa cháy, tổ chức trồng cây, chăm sóc vườn hoa cây cảnh khu vực Lăng, Quảng trường Ba Đình, Khu Di tích K9 và nơi làm việc…
Từ các phong trào thi đua đã phát huy được nhiều sáng kiến cải tiến kỹ thuật áp dụng vào sản xuất, làm lợi hàng trăm triệu đồng. Nhiều cán bộ, đoàn viên công đoàn có thành tích xuất sắc trong phong trào thi đua được Tổng Liên đoàn Lao động Việt Nam, Tổng cục Chính trị, Bộ Tư lệnh và đơn vị khen thưởng.
Năm 2021, đội tuyển thợ của Bộ Tư lệnh tham dự Hội thi thợ giỏi cấp toàn quân giai đoạn 2016 - 2021, kết quả đạt giải Ba toàn đoàn, 1 đồng chí đạt giải Ba nghề Hàn; và 4 đồng chí đạt danh hiệu thợ giỏi cấp toàn quân.

Luôn xác định chức năng chăm lo đời sống cán bộ, đoàn viên công đoàn là nhiệm vụ hàng đầu, là chức năng cơ bản của tổ chức công đoàn. Vì vậy các công đoàn cơ sở đã cùng với chỉ huy các cơ quan, đơn vị thường xuyên quan tâm, chăm lo về đời sống vật chất, tinh thần và thực hiện tốt các chế độ chính sách đối với đoàn viên công đoàn;
Chú trọng làm tốt công tác tuyên truyền, giáo dục làm cho đoàn viên hiểu rõ hơn quyền lợi và nghĩa vụ của mình để cùng chỉ huy đơn vị chăm lo cải thiện điều kiện làm việc, vận động mọi người chấp hành kỷ luật lao động, các nội quy, quy chế của đơn vị.
Tổ chức tốt Phong trào "Xanh-sạch-đẹp" cải thiện môi trường sinh thái, đặc biệt là cải thiện môi trường làm việc cho đoàn viên công đoàn; điển hình là công đoàn cơ sở Đoàn 195, công đoàn cơ sở Đoàn 595, Ban Quản lý Quảng trường Ba Đình đã phát động 100% tổ công đoàn và chỉ huy đơn vị tham gia cải tạo cảnh quan nơi làm việc;
Xây dựng vườn hoa, bể cá công đoàn góp phần cải thiện điều kiện làm việc và xây dựng doanh trại ngày một khang trang, sạch đẹp. Những nơi dễ xảy ra cháy nổ được trang bị phương tiện phòng chống cháy nổ đảm bảo an toàn cho người lao động...

5 năm qua, tuy còn nhiều khó khăn, thách thức tác động, song dưới sự lãnh đạo, chỉ đạo của Thường vụ Đảng uỷ Đoàn 969, Thủ trưởng Bộ Tư lệnh, sự chỉ đạo, hướng dẫn của Ban Công đoàn Quốc phòng, của Phòng Chính trị, phong trào công nhân và hoạt động công đoàn đã hoàn thành toàn diện các mục tiêu, chỉ tiêu Chương trình hành động Đại hội công đoàn Bộ Tư lệnh lần thứ V (2018-2023) đề ra.
Hoạt động của công đoàn đã bám sát tình hình nhiệm vụ đơn vị, chú trọng đổi mới nội dung, hình thức, phương pháp, đẩy mạnh công tác giáo dục chính trị, pháp luật, chăm lo bảo vệ quyền, lợi ích chính đáng của đoàn viên công đoàn. Tổ chức công đoàn thường xuyên được củng cố, kiện toàn, chất lượng đội ngũ cán bộ, đoàn viên được nâng lên.