Ở giải đấu năm nay, ban tổ chức quyết định nâng tổng số đội dự giải lên con số 12. Vì vậy, ngoài 8 đội nhất nhì ở 4 bảng cùng với 2 đội đồng chủ nhà, 2 đội đứng thứ ba có thành tích tốt nhất cũng sẽ giành quyền dự vòng chung kết.
Theo đó, 10 đội bóng đã xuất sắc vượt qua vòng loại để ghi tên mình vào chơi vòng chung kết, gồm: U21 Viettel, U21 Hà Nội, U21 PVF-CAND, U21 Kon Tum, U21 Đà Nẵng, U21 TPHCM, U21 Long An, U21 Khánh Hòa, U21 Đắk Lắk và U21 Tây Ninh. Ngoài ra, giải đấu còn có sự góp mặt của 2 đội chủ nhà Thanh Hóa và Sông Lam Nghệ An.
Mặc dù là những nhà đương kim á quân của giải, nhưng năm nay, U21 Bình Dương không đăng kí dự giải. Đây là sự vắng mặt khá đáng tiếc của thầy trò huấn luyện viên Võ Hồng Phúc. Trong khi đó, một đối thủ khác cũng được đánh giá cao là U21 Hoàng Anh Gia Lai cũng không vượt qua vòng loại dù được đá trên sân nhà.
Vào chiều 16.9, ban tổ chức giải đấu sẽ tiến hành bốc thăm, chia bảng thi đấu cho 12 đội dự vòng chung kết vào 3 bảng. Theo đó, bảng A và B sẽ thi đấu tại sân Thanh Hóa, các trận đấu tại bảng C sẽ diễn ra tại sân Vinh (Nghệ An).
Các trận đấu tại vòng chung kết U21 Quốc gia 2023 sẽ chính thức khởi tranh từ ngày 18.9 và kết thúc vào ngày 1.10.2023.
