Nước súc miệng nếu dùng đúng cách sẽ rất tốt, giúp diệt vi khuẩn có hại cho răng. Ngược lại, dùng quá nhiều, không theo chỉ dẫn, sẽ diệt một số vi khuẩn có lợi, làm thay đổi môi trường cân bằng vùng miệng.
Thậm chí có trường hợp còn gây ố răng, hư những mảnh trám răng, rối loạn vị giác, kích ứng miệng, lưỡi... Không nên lạm dụng nước súc miệng, chỉ dùng không quá 2 - 3 lần/ngày. Với nước có chứa fluor, chỉ dùng ngày 1 lần. Do nước súc miệng chứa lượng cồn cao làm mất nước, nên nếu sử dụng quá nhiều lần sẽ gây khô miệng. Tình trạng này kéo dài quá lâu có thể dẫn đến bệnh hôi miệng, tăng thêm tình trạng sâu răng... Ngoài ra, sử dụng thường xuyên và lâu dài, nước súc miệng có thể gây cảm giác nóng rát trong nướu, lưỡi...
Chỉ nên coi nước súc miệng là một “vũ khí” hỗ trợ kem đánh răng để làm sạch răng miệng và các mảng bám trên răng, thay vì sử dụng nó để thay thế kem đánh răng. Nên ngậm khoảng 30 giây để nước súc miệng tiêu diệt các loại vi khuẩn trong khoang miệng. Sau khi dùng nước súc miệng, không nên ăn hoặc đánh răng sau khoảng nửa giờ. Lưu ý không được nuốt nước súc miệng. Nên chọn mua những loại có uy tín đã được cơ quan chức năng kiểm chứng chất lượng. Mặc dù có nhiều loại khác nhau, nhưng nước súc miệng chỉ có tác dụng hạn chế sâu răng, sát khuẩn chứ không chữa được sâu răng hay làm trắng răng như một số người nhầm tưởng.
